Aplikacije ponekad bez upozorenja nestanu iz pokretača Android Auta, što je najčešći problem korisnika. U većini slučajeva aplikacija nije trajno uklonjena, nego je isključena postavkama za optimizaciju baterije na telefonu. Na Samsung uređajima Android automatski onemogućuje nekorištene aplikacije kako bi uštedio energiju, pa ih to uklanja i iz pokretača Android Auta. Da biste aplikaciju vratili, potrebno ju je pronaći na telefonu, po potrebi ažurirati i pokrenuti, a zatim ponovno spojiti s Android Autom. Nakon što se aplikacija otvori, Android je prepoznaje kao aktivnu pa se ponovno pojavljuje u pokretaču na zaslonu vozila.